Detección de microbios de cocina compartidos en hogares europeos

Los seres humanos están constantemente expuestos a diversos microbios que pueden tener efectos tanto positivos como nocivos para la salud. La mayor exposición a estos microorganismos ocurre en interiores, con la mayor colonización bacteriana reportada en la cocina. Hasta la fecha, ningún estudio ha comparado las comunidades microbianas en los hogares de todos los países, lo cual es necesario para determinar si está presente una microbiota central en la cocina.

estancia: El mapeo de la microbiota de la cocina en cinco países europeos revela una variedad de bacterias esenciales en todos los países, superficies de cocina y herramientas de limpieza. Crédito de la imagen: Africa Studio/Shutterstock.com

sobre estudiar

Un estudio reciente publicado en la revista Microbiología Aplicada y Ambiental Mapee los gérmenes en las superficies de la cocina y las herramientas de limpieza para identificar cualquier asociación entre los microorganismos, los objetos domésticos y el país.

Se recolectaron muestras de superficies de cocina y utensilios de limpieza de 74 hogares en Hungría, Francia, Portugal, Rumania y Noruega. Se obtuvieron muestras de la superficie de diferentes utensilios de cocina antes de la preparación de la cena.

Las muestras se obtuvieron de esponjas y paños de limpieza después de la preparación de alimentos y luego se sometieron a extracción de ADN y secuenciación de ADN ribosomal (ARNr) 16S. La diversidad alfa se analizó utilizando el índice de Shannon, las características observadas y la diversidad de fe evolutiva.

Se utilizaron modelos mixtos lineales para probar las diferencias de diversidad alfa entre tipos de muestras y países. El análisis de diversidad beta también se realizó con UniFrac, Jaccard y Bray-Curtis no ponderados y no ponderados. Los análisis univariados y multivariados examinaron las diferencias entre los condados de muestra y las especies.

Resultados

Se analizaron un total de 305 muestras y se detectaron 3.487 unidades subtaxonómicas operativas (sOTU) de más de 18,8 millones de secuencias. Se obtuvo una media de 61.960 secuencias por muestra, con un equivalente de 5.420 secuencias por sOTU.

Los gérmenes de cocina consisten en miembros de 793 géneros de 297 familias. Las secuencias más populares fueron de proteobacteria filo, seguido de Firmicutes, Bacteroidota, Y Actinobacteria la gente.

Los géneros y familias fueron los más abundantes. Acinetobacter, Pseudomonas, Enhydrobacter, Enterobacteriaceae, Y Yersinácea. Cuarenta y cinco sOTU fueron identificados en Acinetobacter sexo con a. Johnson siendo el más común Acinetobacter clasificar.

Sesenta y cuatro Soto Soto están representados seudo sexo. Se identificaron diecinueve sOTU dentro de la familia Enterobacteriaceae.

Había unidades de emergencia 41, 12, 67 y 16 dentro del alcance Bacilo, estafilococo, criseobacteria, Y cocoria géneros, respectivamente. Dieciséis muestras dieron positivo para ListeriaUno de ellos resultó herido Campylobactery nadie estaba salmonela.

En particular, las sOTU relacionadas con s. intestinal Y Shigela/Escherichia se detectaron en muestras de los cinco países, mientras que C. jejuni Estuvieron presentes en muestras rumanas, francesas y portuguesas. La mayoría de estos patógenos fueron relativamente menos abundantes.

La diversidad alfa difirió significativamente entre los tipos de muestras y entre países. Por ejemplo, las muestras de Portugal tenían menos sOTU observadas que las de Noruega y Francia, mientras que las muestras de Noruega, Hungría y Francia tenían niveles similares de diversidad alfa.

Se observaron resultados similares con la diversidad de evolución de Faith. Las diferencias entre países fueron menos pronunciadas cuando los análisis se restringieron a muestras de utensilios de limpieza, pero siguieron siendo significativas cuando solo se consideraron muestras de superficies.

Los mangos tenían la diversidad alfa más alta según los rasgos observados, mientras que las esponjas tenían la diversidad más baja. El análisis de componentes principales (PCA) mostró una tendencia a agrupar los microorganismos por tipo de muestra y país. Aunque los microorganismos en los paños y esponjas de limpieza eran similares, la similitud entre ellos era mayor entre países que entre el paño y la esponja.

Las muestras de superficie se agruparon por país, lo que significa que los microorganismos eran más similares en las muestras de superficie dentro de un país que en una muestra de superficie determinada entre países. Sin embargo, se han observado algunas excepciones a este resultado. Por ejemplo, los microorganismos en las protuberancias francesas eran más similares a los de las protuberancias húngaras que en las otras muestras de superficie francesas.

Se observaron algunas bacterias en esponjas y telas con abundancias relativas significativamente diferentes entre países en comparación con las muestras de superficie. Las muestras de estanques tenían el mayor número de bacterias, con abundancias relativas que diferían significativamente entre países.

Se identificaron ocho géneros/familias como bacteriófagos básicos, que incluían Acinetobacter, Enterobacteriaceae, Pseudomonas, Psychrobacter, Bacillus, Staphylococcus, Enhydrobacter, Y crisobacteria. Quiénes son, Pseudomonas, Enhydrobacter, Y Acinetobacter Fue el único taxón presente en todas las muestras, que también mostró la mayor abundancia relativa media.

Enhydrobacter, Pseudomonas, Y intestinal Se identifican como SOTU centrales. Las bacterias básicas diferían en abundancia relativa entre tipos de muestras y países. Entre los microorganismos esenciales, la abundancia relativa de Psicobacterias, Chryseobacterium, Enterobacteriaceae, Pseudomonas, Y Enhidrobacter Varía mucho entre países.

Hubo diferencias significativas en Acinetobacter Y estafilococo; Entre los tipos de muestras, con la mayor abundancia en muestras húmedas obtenidas de tinas, paños y esponjas, así como mangos, respectivamente. en la misma vena, duro Se mostraron diferencias significativas entre los tipos de muestras, encontrándose la menor abundancia en las muestras húmedas.

conclusiones

A pesar de las diferencias significativas en los parámetros de la cocina, los hábitos dietéticos y las prácticas de preparación de alimentos, se identificó una microbiota de cocina central que consta de ocho taxones a nivel de género/familia, con tres bacterias centrales observadas a nivel de Soto.

En general, los hallazgos del estudio amplían la base de conocimientos sobre los microbios de la cocina. Los estudios futuros deberían vincular estos hallazgos con los comportamientos de seguridad alimentaria y su impacto en la salud humana.