Investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de California en San Diego y la Facultad de Ingeniería Jacobs, junto con colegas de la Facultad de Medicina de Baylor, utilizaron un enfoque de biología de sistemas para analizar la diversidad genética de C.Lo perdido es difícilun patógeno particularmente problemático en entornos de atención médica.
Los Centros para el Control de Enfermedades estiman que las bacterias causan aproximadamente 500,000 infecciones en los Estados Unidos anualmente, con diarrea severa y colitis (colitis) como síntomas característicos.
Los hallazgos de los investigadores se publicaron en la edición en línea del 27 de abril de 2022 de PNAS.
jim saab Es la causa más común de infecciones hospitalarias, en parte debido al uso de antibióticos, que pueden matar suficientes bacterias saludables para permitir el crecimiento descontrolado de Clostridium difficile. La infección es especialmente peligrosa en los ancianos. A una de cada 11 personas mayores de 65 años se le diagnostica una afección relacionada con el hospital jim saab Muere dentro de un mes, informa el CDC.
c diferencia permanente y difusa. No causa la diarrea típica. La mayoría de las personas se recuperan, pero algunas se enferman gravemente y requieren hospitalización y algunas mueren por complicaciones como insuficiencia renal o sepsis”.
Jonathan M. Monk, Ph.D., autor principal, científico investigador en el Grupo de Investigación en Biología de UCSD, supervisado por Bernard O. Palson, Ph.D., Profesor de Bioingeniería y Profesor Asistente en la Facultad de Medicina de la Universidad de San Diego
Para entender la genética de jim saab -; y así desarrollar modelos que puedan identificar y predecir su compleja y continua evolución -; Los investigadores utilizaron la secuenciación del genoma completo, la detección fenotípica de alto rendimiento y el modelado metabólico de 451 cepas bacterianas.
Estos datos se utilizaron para construir un «pangenoma» o un conjunto completo de genes representativos de todos los conocidos jim saab cepas, de las cuales identificaron 9924 grupos genéticos distintos, de los cuales 2899 se consideraron intrínsecos (encontrados en todas las cepas) mientras que 7025 fueron «accesorios» (presentes en algunas cepas pero ausentes en otras).
Utilizando un nuevo método de tipificación, clasificaron 176 grupos de razas genéticamente distintos.
La coautora Jennifer K. Medicamento. «Esto puede ser crucial para comprender las causas de los brotes y cómo combatir su propagación».
Se identificaron experimentalmente treinta y cinco cepas que representan al grupo general utilizando 95 fuentes de nutrientes diferentes, lo que reveló 26 perfiles de desarrollo distintos. Luego, el equipo construyó 451 modelos de metabolismo a escala del genoma específicos de la cepa para producir diversidad fenotípica en 28,864 casos únicos. Los modelos pudieron predecir correctamente el crecimiento en el 76 por ciento de los casos medidos.
“Uno de los puntos fuertes del trabajo presentado es la coherencia de distintos tipos de datos biológicos en marcos biológicos de sistemas integrales que permiten el análisis a gran escala”, dijo el primer autor Charles J. Norsigian, PhD, científico de datos del Grupo de Investigación de Biología de Sistemas. «Por interpretación de dinastías jim saab En el contexto de la población, pudimos arrojar luz sobre los rasgos relevantes para el estrés con respecto al nicho de nutrientes, los factores de virulencia y los determinantes de la resistencia a los antimicrobianos que de otro modo no se habrían descubierto”.
fuente:
Referencia de la revista:
Norsigian, C. J., et al. (2022) Un enfoque de biología de sistemas para la evaluación funcional del pangenoma de Clostridioides difficile revela diversidad genética con poder discriminativo. PNAS. doi.org/10.1073/pnas.2119396119.
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